针对每台仪器建立档案及标准操作规程SOP，每台HPLC档案需包括：品牌、产地、主体流路材质（兼容溶剂）、耐压范围、正相系统或反相系统（主要看泵密封圈材质）、对应维修工程师及应用工程师的联系。保证出现问题时快速联系获取解决方案，将仪器的损害尽可能的降低。

HPLC主体流路材质一般有不锈钢SST、钛Ti或MP35N（MP35N合金是一种无磁的镍钴铬钼合金），普通液相系统无特殊说明一般为不锈钢系统，钛或MP35N多用于BioHPLC系统中，比不锈钢系统更耐腐蚀，和更好的生物兼容性。

针对每台仪器编写完整的操作规程，应涉及到电压、开关机顺序及注意事项，使用人在申用仪器时应注意仪器的情况，发现问题及时记录并上报。对仪器的使用和维护记录严格审核。