包合法，又称包接配位法、分子包埋法，该法是利用β-环糊精中空且内部疏水外部亲水的结构特点，将疏水性芯材通过形成包结络合物而形成分子水平上的微胶囊。

环糊精对风味物质具有很好的保护作用，它能有效的防止热和蒸气的破坏。

β-环糊精是含有7个葡萄糖基毗喃环的冠状分子，环糊精的内部呈亲油性，外部呈亲水性，象一个空的分子微胶囊，环糊精可以捕集具有合适的形状和极性的客体分子。当复合物处于干燥状态时，客体分子可以被很好的保护起来，避免光、热和氧气的破坏。在与水接触时胶囊化的分子可以从分子包埋体系中释放出来。

该法形成的微胶囊具有吸湿低，可以长期保存，包覆均匀、结合牢固的优点。

缺点为该法载量低，一般为9-14%，对一些分子来说，β-环糊精相当于"人工酶“，加速了酯的水解反应，造成风味的改变对于水溶性风味物质，产率更低，该法要求芯材分子大小要适应疏水中心的空间位置，而且必须是极性分子，这就大大限制了该法的应用。包合法目前主要应用于香精、色素及维生素等微胶囊化。